Os Programas de Preparação para a Universidade (PPU) compõem uma carga horária curricular semanal, com o objetivo de fortalecer o estudo teórico, a partir de atividades práticas nas três áreas do conhecimento (Exatas, Humanas, e Ciências da Natureza).
Para isso, os Colégios Embraer oferecem diversos laboratórios, onde os estudantes desenvolvem, em conjunto com professores e voluntários, e Organizações parceiras, projetos multidisciplinares e com foco nos Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS). As práticas aproximam os jovens da dinâmica das profissões e do mercado de trabalho e estimulam a experimentação e criatividade, gerando, muitas vezes, impacto social para a sociedade.